ينحدر الشيخ نبيل محمد الشريف الحسيني الأزهري من أسرة علمية عريقة في لبنان، فوالده الشيخ محمد الشريف كان قاضياً شرعياً في عدد من المحافظات اللبنانية، ثم تولّى منصب مستشار في المحكمة الشرعية السنية العليا في بيروت حتى وفاته. أما جدّه الشيخ محمد هاشم الشريف فكان أمين الفتوى في أيام الوليّ الصالح الشيخ مصطفى نجا مفتي الجمهورية اللبنانية في ذلك الوقت.

نال الشهادة من أزهر لبنان، ثم تابع دراسته في جمهورية مصر العربية في جامعة الأزهر – كلية الشريعة والقانون، وحصل على شهادة الماجستير في الفقه المقارن من الجامعة العالمية، ثم نال شهادة الدكتوراة من جامعة مولاي إسماعيل في مكناس في المغرب.

ومنذ صغره، لازم الشيخ المحدث الفقيه الحافظ عبد الله بن محمد الهرري، فأخذ منه العلم وقرأ عليه في الفقه الشافعي كتاب سلم التوفيق إلى محبة الله على التحقيق، وشرح له الشيخ عبد الله هذا الكتاب، كما سمع منه شرح كتاب الزبد لابن رسلان.

سمع ودرس على يد الشيخ عبد الله الهرري في مختلف علوم الشريعة، من الفقه الشافعي والتفسير والعقيدة وأصول الفقه ومصطلح الحديث، إلى علوم اللغة العربية كالنحو والعَروض، كما قرأ عليه في كتب الحديث ومن شرح الصحيحين وغيرهما.

كما قام بشرح وحلّ ألفاظ أبي شجاع وحلّ ألفاظ المختصر، وكتب رسائل في الرد على أهل الضلال والفرق الشاذة عن أهل السنة والجماعة.